As eleições municipais acontecem em meio à pandemia de Covid-19. Por este motivo, diversos protocolos são adotados para evitar a contaminação no dia do pleito, em 15 de novembro.
Uma das solicitações dos cartórios eleitorais é de que cada pessoa, além de fazer uso da máscara, leve caneta para assinar a documentação, visto que não haverá uso da biometria. Além disso, a recomendação para quem apresentar sintomas compatíveis com a doença, como febre no dia da votação, é que não se dirija à seção eleitoral.
A chefe do cartório eleitoral de Ijuí, Sônia Reinke afirma que é necessário a pessoa procurar atendimento nas unidades de saúde específicas para casos suspeitos Covid, solicitar atestado médico e justificar a ausência até 60 dias após a eleição no site do Tribunal Regional Eleitoral.