As vacinas que protegem contra febre amarela estão disponíveis em todos os ambulatórios de Ijuí, além do posto central. Porém, as doses são disponibilizadas somente às quintas-feiras, devido ao frasco ser multi dose, ou seja, em um mesmo recipiente existem doses para mais pessoas. A Secretaria de Saúde afirma que desta forma é evitado o desperdício e a falta de vacinas no futuro.
Depois de algum tempo sem existir, em 2020 o Ministério da Saúde voltou a disponibilizar as doses da vacina. A primeira dose, de rotina, é aplicada em crianças de nove meses e, desde janeiro, os municípios disponibilizam reforços à comunidade.